Bioinformática

Despues de recibir miles de emails pidiendo una explicación de qué es la bioinformática. Como todos sabéis, se trata de hacer yogures Bio utilizando la informática, es decir, buscando la receta en el Google. En realidad no es así, jejeje(estoy de un salao ultimamente), por ello he pensado que como introducción podría comentar por encima las asignaturas que he tenido hasta ahora, para que tengáis una idea de qué va esto.

Statistics: curso de apoyo en el que nos explican los fundamentos de estadística y probabilidades, que serán de utilidad en muchas asignaturas. La estadística se utiliza abundantemente en bioinformática. Estaba principalmente pensado para gente que hacía tiempo que no tocaba las mates.

Mathematical Biology and Virtual Cell: tras este nombre tan largo se esconde una asignatura que mezcla biología, circuitos eléctricos y matemáticas. El principal objetivo de esta asignatura es crear modelos matemáticos dels comportamiento de las células, principalmente del transporte de iones(de calcio, potasio,...) a traves de las membranas celulares. El comportamiento de las células(como entran y salen iones dependiendo del estado interior y exterior de la célula) se parece al de un circuito eléctrico, por tanto se pueden extraer fórmulas, ecuaciones y simularlas en una computadora. Las cúlas B del páncreas, las neuronas y algunas células músculares son las típicas que se estudian aquí. Como ejemplo, se intenta que las células B respondan a estímulos eléctricos generando insulina.

Pattern Recognition: hasta ahora ha sido La Asignatura. Dura dura, pero de gran aplicación en muchos ámbitos. Un ejemplo cutre de lo que intenta el reconocimiento de patrones es poder decidir si lo que analizamos es una manzana o es una pera, basándonos en ejemplos anteriores. Obviamente es una computadora quien tiene que decidir. Otro ejemplo sería el procesar cuáles son las características más importantes(color, tamaño, textura, forma) que hacen a una manzana diferente de otras cosas y que la máquina pudiera decidir en objetos futuros de que se clase es el objeto analizado. Otro ejemplo sería poder predecir a partir de la previsión meteorológica (temperatura, húmedad, viento) el consumo eléctrico para esa zona.
Todo esto conlleva que se han de medir las características del objeto analizado, seleccionar las más importantes, agrupar los objetos según sus similitudes, clasificarlos, evaluar costes y errores, etc.. Para todo esto se utilizan muchos conceptos estadísticos y matemáticas, así como muchos algoritmos. Tiene infinidad de aplicaciones, desde analisis de ADN, pasando por prevision de gatos, hasta minería de datos o datamining.

Databases and datamining: la decepción del primer semestre, me esperaba bastante más. Ha sido una exposición poco interactiva de las últimas tendencias en bases de datos y datamining. Por ejemplo bases de datos especiales para genética, o para almacenar flujos continuos de información, como pueden ser las lecturas de varios sensores, o bases de datos en las que guardar datos multimedia (fotos, videos, audio) y poder buscar por el contenido, esto es, buscar fotos que contengan 2 coches, o que se parezacan a una foto que tú suministras al sistema, etc..


Molecular Genetics: una introducción a la genética molecular. Se explica como funciona una célula por dentro, todos los pasos que conlleva la reproducción de las células, como se organiza internamente el material genético, cuáles son las moléculas que intervienen en los diferentes procesos, etc.. Una asignatura muy interesante, ya que representaba la primera inmersión en biología pura y dura.

Hasta aquí la introducción de lo que he estudiado estos meses. Vista la gran demanda por conocer más sobre la Bioinformática, en las próximas semanas comentaré algunas de las campos en los que se aplica. También estaba considerando la idea de abrir un blog exclusivo sobre bioinformática (en inglés, para llegar a un público más amplio) en el que comentar con más detalle contenidos de mis asignaturas así como novedades que tengan que ver con la Bioinfórmatica. No es que esté muy puesto en esto último, pero sería como una forma de obligarme a buscar, leer y aprender a la vez que hago un poco de divulgación.
¿Qué os parece?
Espero vuestros comentarios.

Llegó la hora

La vida del estudiante, es muy buena, más aún si está de Erasmus o en el extranjero. Pero a pesar de conocer mucha gente, ir a muchas fiestas, aprovechar para viajar, etc., tiene momentos malos. En estas fechas se vive un de estos momentos, que tendrá una reedición en junio. Se trata de las despedidas.
Antes de Navidades casi todos vuelven a casa para pasar las vacaciones, algunos volverán en enero unas semanas para hacer exámenes y ya está, otros estaran hasta junio, pero varios ya no regresaran a Leiden. De entre los últimos se encontraba Cinta, la mayor de todos los españoles pero la más marchosa, simpática, salada e inteligente de la primera hornada de Erasmus. Siendo de Sevilla, la gracia y el picante se le desbordan. Cómo voy a echar de menos a ""Puri"!!
Hoy tocaba despedida de otra persona a la que le he cogido cariño, Eloy Eduardo, mexicano, el de los insultos en la discoteca. Siempre dispuesto a echar unos tragos, unas cubas, a reir, a preguntar por la política y la historia de España, hemos pasado buenos momentos, como cuando se paso 45 minutos tocando la guitarra y cantando solo para cuatro colegas. Vuelve para su Cuernavaca a acabar relaciones internacinales e intentar hacer una maestría en USA, que haya suerte wey!!! A huevo!!!
Y como alguién dijo, en esta vida todos estamos de paso y mucha gente pasará por ella. Si con ellos puedo pasar buenos momentos, aprender y disfrutar, y porqué no, aportarles algo, ya seré feliz.
Que la diosa fortuna os sonría allá donde vayáis y que vuestro camino a Ítaca esté lleno de aventuras.
Buenas noches y buena suerte.

Gente - MACS

Voy a hablar de gente que pasa por mi vida y que por alguna extraña razón, me marcan. Es ese tipo de gente que son peculiares, que salen de lo corriente por su actitud, su manera de afrontar la cotidianeidad. Por esa gente de la que te gustaría que se te pegara algo, por esos héroes anónimos, por ellos hoy empiezo, a ver cuánto me dura el ánimo.

El primero va a ser MACS, Martín Alejandro Carmona Selva, excompañero de trabajo, puesto que viendo su web me ha apetecido escribir esto. Martín al principio no atrae, para que nos vamos a engañar. Es un tipo, corpulento, si, digamos que su barriga es corpulenta, su espalda es corpulenta, todo él es corpulento, cada uno de sus gemelos es como mi cabeza. Va siempre acelerado, como nervioso, a trancas y barrancas, como atolondrado, siempre acalorado. Con sus gestos que ya son tics. A veces te mira con unos ojos que parece que te quisiera arrancar la cabeza. Cuando habla, parece que quiera batir el récord de palabras por minuto, cosa que al principio, viniendo de un argentino con acento argentino cerrado, resulta cuanto menos una experiencia dolorosa. Digamos que si te dejas llevar por las primeras impresiones y la superficialidad no establecerías contacto con Martín.
Pero Martín sorprende. Siempre está apunto para darte una respuesta, para levantarse de la mesa del trabajo y echar un vistazo a tu ordenador que sigue funcionando mal. No hay momento en el que no desprenda buen humor y alegría. Siempre tiene un comentario afilado, una puntualización graciosa, una anécdota o un chiste a punto. Oh los chistes, cada día había repertorio nuevo, 2 o 3 por lo menos. Míticos los de las abuelas y sus consoladores. También mítica su imitación de un Paraguayo, que con voz de oso atronaba día si día también por la oficina. Míticas las sillas que se cargó por "dejarse caer" sobre ellas, o las mil veces que se manchó la ropa (en la oficina, el quita manchas de la ropa seguramente se compró por él) o las veces que ha derramado el café.
A parte del buen humor, Martín destaca por que tiene interés por todo. Se fija en los detalles, en las situaciones cotidianas que nosotros no vemos y las mezcla con su humor, creando unas historias que hacían que el regreso a casa pasará rápido. Quiere saber, lee, aprende, experimenta, juega, pregunta, mira, haciendolo todo alegría. Eso se transmite, cuando ves a alguien que hace interesante cada momento y cada experiencia de su vida, por simples que sean, quieres que algo se te pegue. Todo hecho con modestia y humildad, si ya se que humildad y argentino no pegan, pero bueno, es así. Es así, una fuente de sorpresas de efecto retardado, que se activa cuando has dejado atrás la etapa de la superficialidad.
Y es que siendo como un oso, como no le vas a coger, perdón, agarrar cariño.

Para acabar, una de sus frases recurrentes: "don't expect me to fit in your world, I can barely fit in mine"

PD: huelga decir la sobada frase de "si todo el mundo fuera como" la gente de esta serie de artículos "el mundo sería un lugar mejor para vivir"

Cuando haces el primo

En un minuto sale el tren para La Haya, mierda, espabílate a sacar el billete que lo pierdes.
Pago rápidamente en la máquina los 3€ y con los nervios, ni espero a que salga el billete. Me daré cuenta cuando volviendo de La Haya un revisor me lo pida. No será nada amable ni comprensible. Ni tan siquiera cuando le ponga cara de niño pobre, ni cuando le enseñe los billetes que he comprado durante 4 meses (2 o 3 por semana), ni cuando le recuerde que es Navidad, ni cuando le diga que mi unica identificación es el DNI español que no entenderá. No, él sólo responderá "muy bien, pero enséñame el billete".
Esperando estoy a que me llegue una carta con los 40€ de multa. Si es que las prisas no son buenas, ya lo dice el refrán: desvísteme rápido, que soy eyaculador precoz.

La charla del pescao

Alegremente me dirigía al supermercado Hoghvlied escuchando La Excepción. Aparco despreocupadamente mi bici y tal como levanto la cabeza veo dos semi-yonkis a metro y medio de mi máquina. Pum pum, pum pum, ¿la dejo o no la dejo? Si me la llevo a otro sitio sabran que lo hago por que no me fio de sus pintas. Pues nada, acabo de poner los dos candados, que se vea claramente que son de calidad, y me levanto sacando pecho y intentando parecer más alto, "que sepan con quien se las tendran que ver si tocan mi burra". Su respuesta "hey brother, do you have a cigarrette??" Pues va a ser que no, dejé de fumar en alguna vida pasada. "And what about 50 cents". Va a ser que tampoco, los necesito para el carro del super. De repente el segundo colgao despierta del letargo y dice lo que todos esperan, "where are you from?". Spain - Barcelona. Y lo de siempre: "I like Barcelona very much, I have been there....bla bla bla". A yonky2 le mola Barcelona por que según él, el hachís es de calidad, por estar cerca del moro. También le gustaba la gente y que se podía fumar tranquilamente sus canutos en la calle sin que le molestaran. Pues vaya estilo de vida pienso yo. Pero vamos a pasarlo bien, me inventaré algo. Si, voy a parecer que se mucho de drogas en Barcelona. Explicaré cosas de la policía secreta, de que quitan los porrillos a los chavales para fumarselos ellos, de los tipos de hachís que encuentras de Barcelona y cuatro paridas más. Total, al cabo de 20 minutos yo era un tio legal, enrollao y que dominaba el tema. Pero la diversión llega a su fin, me piro que me cierran el super.
Ya no me haran nada en la bici.

Ventajas de no estar en España

El hecho de no estar en España tiene cosas malas, como que no estas con la mama y las cosas no se limpian solas o la ropa no llega planchada al armario por arte de magia. Los pocos chistes que recuerdo y las gracias que se me ocurren no suenan igual de bien en inglés que en castellano. Y el cachondeo...aquí ni saben lo que es el cachondeo.
Pero por otro lado, estar fuera de tu país, tiene una serie de beneficios que aunque invisibles, se pueden llegar a detectar. Navego a diario por internet, pero intento no cebarme a visitar paginas españolas de noticias actualidad, tampoco tengo ningún canal de televisión español ni escucho radio española. Con todo esto, he conseguido eliminar de mi dieta diaria unas toxinas muy malignas que creo que a la larga me hubieran ocasionado una úlcera o aún peor, que me hubiera vuelto loco e intentase hacer un remake de "La matanza de Puertohurraco". Para mi fortuna, ya no tengo que oir a diario los improperios que se sueltan nuestros políticos, el uso partidista que hacen de las desgracias que sufrimos los españoles y la desbordante cantidad de bilis que sueltan la Cope, ABC, Mundo, LibertadDigital y algunos que añoran dictaduras pretéritas.
El estar en los Paises Bajos conlleva que la fiebre consumista de las Navidades no me afecta, con el ahorro de dinero y tiempo que esto conlleva. Aquí puedo encender la televisión sin miedo a que me aparezcan los esperpentos del mundo del corazón y la prensa rosa. Pero lo mejor, lo que creía que nunca pasaría, lo inimaginable, lo inaudito, lo mejor de lo mejor de lo mejor jo tia que te lo juro, lo mejorcito es que...

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David Bisbal sacó un disco y yo no me he enterado!!!!!

y es que la vida puede ser maravillosa, Salinas!!